Министерство образования и науки разработало положение об агентстве научных организаций, которое будет управлять имуществом и институтами РАН. Главу агентства назначит правительство по согласованию с президентом. Научно-координационный совет агентства, который депутаты Госдумы называют "по сути главным руководящим органом", сформируют на паритетных началах. В него, в частности, войдут ученые, назначенные президентом, члены РАН, избранные общим собранием. Однако в положении не прописана система соподчинения совета и главы агентства, в чем депутаты видят опасность.