Со второй попытки "Росатому" удалось отказаться от внутренней конкуренции собственных инжиниринговых структур: московский "Атомэнергопроект", до последнего сохранявший независимость, передается под управление холдинга НИАЭП—АСЭ. До 2012 года в госкорпорации существовало несколько инжиниринговых центров, но большинство из них не смогло работать без аварий на стройках и без срывов сроков. Холдинг может получить большую часть заказов по инвестпрограмме "Росатома", в 2014 году составлявшей 320 млрд руб.