Бах оставил много научных работ в самых разных областях биохимии, которой как науки и не было, когда он начал ей заниматься. Но главным вкладом Баха в биохимию сегодня считается его теория медленного окисления с образованием перекисей. По сути это было первое научное объяснение того, как дышит живая клетка. Еще со времен Ломоносова и Лавуазье ученые понимали, что окисление при горении и при дыхании живых существ — в своей основе один и тот же процесс. Он идет с выделением энергии, и за счет этой энергии мы живем. Но как присоединяют кислород и превращаются в окислы, то есть «горят» в клетке питательные вещества без пламени и высокой температуры, было непонятно, потому что противоречило всем законам науки химии.