С точки зрения Минфина наибольшие дыры в системе ОМС в федеральном масштабе — это Дагестан (где, очевидно, система госгарантий не исполняется, как и в случае с другими республиками Северного Кавказа, в первую очередь из-за сверхвысоких уровней безработицы, во вторую — в силу завышения расходов, в том числе с коррупционными интересами), но также и Приморский край, Челябинская, Кемеровская области и другие промышленно развитые территории РФ с большим числом населения. Лишь для части очень дефицитных регионов (с валовым дефицитом финансирования госгарантий более чем 5 млрд руб.) происходящее объясняется, как в случае с Иркутской областью, высокими логистическими и транспортными расходами в медицине. В числе крупных проблемных регионов по этому показателю также Башкирия, Красноярский край и Ростовская область: здесь основной причиной недофинансирования, в отличие от других регионов, можно предположить именно низкие доходы региональных бюджетов в сочетании с относительно низкими доходами населения, формирующими недостаточные для гарантированных расходов системы ОМС страховые платежи. Де-факто экономическое состояние этих регионов, не сильно отличающихся по базовым характеристикам от регионов-соседей, не позволяет без существенных вливаний со стороны федерального центра содержать систему здравоохранения, соответствующую местным доходам в экономике. При этом в рейтинге есть и уникальный пример — Бурятия, где расходы на местную программу госгарантий втрое меньше, чем у ближайшего «снизу» региона,— 2,5 тыс. руб. на человека в год.
В пересчете на душу населения объемы гарантий медпомощи «в деньгах» дифференцированы не слишком сильно — более 80 млн населения в «дефицитной» зоне ОМС система обеспечивает расходы на здравоохранение на уровне 7,5–10 тыс. руб. в год, еще более 10 млн жителей малоосвоенных регионов (в основном на Дальнем Востоке) — 10–15 тыс. руб. При этом какой-либо закономерности в размере дефицита обнаружить почти невозможно — при сходной численности населения, преобладающем типе населения и сходных подушевых доходах размер дефицита может составлять и 24,5% (Ивановская область), и 9,1% (Орловская область), и 4% (Тульская область), что, вероятно, указывает на завышение расчетного объема программ для ряда регионов. В ряде случаев объемы программ к доходам населения, в среднем для РФ составляющие 35–40%, превышают 50% — для территорий европейской России (например, для Мордовии — 67%) это также может указывать на относительное завышение медрасходов в системе ОМС.