Комиссию по модернизации, созданную указом президента 20 мая 2009 года, возглавляет сам Дмитрий Медведев. У него два заместителя — Владислав Сурков и Сергей Собянин. Однако в наибольшей степени работой комиссии ведает помощник президента Аркадий Дворкович, являющийся ее ответственным секретарем. В его аппарате готовят заседания комиссии, собирают заявки по инновационным проектам, а также готовят список президентских поручений по итогам заседания комиссии. Обязанности членов комиссии (их помимо президента 19 человек) четко не определены. Их функционал примерно понятен, исходя из задач комиссии, основными из которых являются выработка госполитики в области модернизации и координация федеральных органов исполнительной власти, субъектов федерации, предпринимательского и экспертного сообществ в области модернизации. Именно поэтому в комиссии представлены члены правительства: министр финансов Алексей Кудрин, министр экономического развития Эльвира Набиуллина, министр промышленности и торговли Виктор Христенко, министр связи и массовых коммуникаций Игорь Щеголев, министр образования и науки Андрей Фурсенко, вице-премьер Сергей Иванов, а также делегаты от реального сектора — гендиректор госкорпорации "Роснано" Анатолий Чубайс, президент группы ОНЭКСИМ Михаил Прохоров и председатель совета директоров Digital Sky Technologies Limited Юрий Мильнер, директор Российского научного центра "Курчатовский институт" Михаил Ковальчук.